Boletim do projeto Атлас дикой природы России | Wildlife Atlas of Russia

03 de julho de 2020

Первый по объему источник данных о биоразнообразии России

2 июля произошло очередное обновление набора данных iNaturalist в GBIF. После чего данный ресурс стал первым по числу находок источником данных о биоразнообразии России !!! В то время как общее число находок для территории России, опубликованных в GBIF, приближается к 5-миллионной отметке.



Следует отметить, что таксономическая структура данных iNaturalist для территории России отличается от всего массива. Глобально три группы представлены примерно поровну: сосудистые растения, позвоночные (в основном птицы) и насекомые, а нас же большее внимание направлено на растения и гораздо меньшее - на беспозвоночных.(цвета на визуализации портала GBIF по группам не совпадают)



Примечательно, что кроме iNaturalist, среди основных ресурсов для России представлены еще две системы любительских наблюдений - отечественная орнитологическая сеть RU-BIRDS.RU и глобальная eBird.org. Последняя, кстати, является крупнейшим источником данных для GBIF (700 М находок или около 45 % от всего объёма) и в соответствующем наборе данных недавно тоже произошло очередное обновление, в результате чего объем данных в GBIF глобально превысил 1.5 миллиарда находок!
Для России же эти три источника составляют более миллиона находок или около 25 % от всего объема и очевидно, что вклад натуралистов-любителей в общедоступные данные о биоразнообразии далее будет всё возрастать.
На сегодняшний день общий объем данных исследовательского уровня (Research Grade) в системе iNaturalist более 25М наблюдений, которые сделали 804 063 натуралиста. В России число таких находок приближается к одному миллиону, число участников с хотя бы одной RG находкой чуть менее 10 тыс.
Но в набор данных GBIF попадают только те наблюдения, лицензия которых позволяет использовать их в научных исследованиях. Поэтому мы рекомендуем указывать лицензию CC-BY, что соответствует давно устоявшейся практике научного цитирования. CC-BY-NC тоже допустима.

Publicado em 03 de julho de 2020, 11:02 MANHÃ por max_carabus max_carabus | 3 comments | Deixar um comentário

30 de junho de 2020

!!! 1 000 000 наблюдений !!!

Общее число наблюдений, сделанных на территории России, достигло Одного Миллиона, произошло это 28 июня примерно в 15:20. Имеются в виду наблюдения исследовательского уровня (Research Grade) - их около 80 % от общего числа и наблюдения, у которых не хватает подтвержденного определения (Need ID).
Первое наблюдение для России добавлено в iNaturalist в 2011 году, но более-менее постоянная активность появилась весной 2017 года, т.е. для первого миллиона потребовалось чуть более 3х лет. Миллионным наблюдением стал Fomitopsis mounceae выросший в Ханты-Мансийске, судя по фотографии, на лиственнице, сделала юбилейное наблюдение Светлана Царахова (@svetlanakhanty) https://www.inaturalist.org/observations/51214390

Некоторые факты:
1. За первую половину 2020 года добавлено наблюдений больше, чем за все предыдущие годы, имеется в виду дата создания наблюдения в системе.

2. Число активных натуралистов превысило таковой показатель для всего прошлого года, а число опытных участников, которые делают наблюдение не первый год сравнялось с числом всех натуралистов 2018 года.

3. Доля участников, которые сделали более 10 наблюдений постепенно увеличивается, что говорит о том, что не только больше людей узнает об системе любительских наблюдений iNaturalist, но и интерес растет среди тех, кто уже зарегистрировался.



4. Для территории России отмечено более 15 тыс. видов с подтвержденным определением,
в основном это:
сосудистые растения - 6 991 вид,
насекомые - 4 815 видов (сами понимаете, такое число незаслуженно малое, но тем не менее что-то уже есть)
и грибы - 1 798 видов

5. Больше половины накопленных находок представлены в глобальной информационной системе по биоразнообразию GBIF и соответствующий набор данных сейчас является вторым источником информации о биоразнообразии России по числу записей, но судя по всему вскоре станет первым.
https://www.gbif.org/occurrence/map?country=RU&dataset_key=50c9509d-22c7-4a22-a47d-8c48425ef4a7

Свой вклад в изучение природы России может сделать каждый.

Publicado em 30 de junho de 2020, 06:12 TARDE por max_carabus max_carabus | 0 comments | Deixar um comentário

19 de junho de 2020

10 000 натуралистов !!!

Активность российских цифровых натуралистов пересекла очередную веху. Число участников достигло 10 тыс. человек !! Это все, кто сделал хотя бы одно наблюдение на территории России, начиная с 2011 года. Очевидно, далеко не у всех интерес и мотивация делать новые наблюдения более-менее постоянны, поэтому число активных натуралистов в этом году чуть больше половины от всех. Но тем не менее обращают на себя внимание две вещи: во-первых, число натуралистов в этом году уже превысило таковое в прошлом, во-вторых, доля участников, которые делают наблюдения не первый год, выросла почти раза в три и на сегодняшний день составляет около 30 %.

Пост на эту тему в группе GBIFru с графиками:
https://www.facebook.com/groups/477172382940229

Publicado em 19 de junho de 2020, 09:21 TARDE por max_carabus max_carabus | 1 comment | Deixar um comentário

26 de abril de 2020

7000 натуралистов !!!

В системе любительских наблюдений iNaturalist за предыдущие недели две общее число наблюдений перевалило за 35 миллионов, набор данных iNaturalist в GBIF, который включает находки исследовательского уровня с подходящими лицензиями превысил 14.5 млн и стал 7м по числу находок набором данных в GBIF.
Тем временем, общее число наблюдений в России перевалило за 600 тыс., исследовательского уровня стало более полумиллиона, а число находок требующих определения превысило 100 тыс. Последнее достижение немного сомнительное, наверно, так как показывает, что число число таких находок растет, но при этом это только 18% от общего числа находок, в то время как глобально - 38.

Самое интересное, что число участников iNaturalist в России, сделавших хотя бы одну находку "в дикой природе", стало более 7000 !!! Попробуем разобраться подробнее, что скрывается за этим числом.

Насколько натуралисты активны. Подавляющее большинство участников сделало всего несколько наблюдений, 2576 человек только одно наблюдение, 918 - два, 525 - три, 323 - четыре, ну и так далее по убывающей, что изображено на рис. 1 в виде гистограммы. Обратите внимание, что шкала логарифмическая (!), а минимальный размер "столбика" - это один натуралист. Если всех разделить на группы по числу находок, то картина будет следующая (рис. 2) - 73% - это те, кто сделал несколько находок и пока этим ограничился, 19% - собирает время от времени и пока набрал не более 100 находок, тех же, кто собрал более 500 находок пока около 3 %. Судя по всему, с точки зрения сбора данных будут полезнее 1000 человек, собравших по 500 находок, чем 25 "маньяков", собравших по 20 тыс. Но чтобы это показать - нужен более серьезный анализ

Динамика активности. Еще один важный показатель - это число опытных натуралистов, собирающих наблюдения не первый год. Если посмотреть на график отражающий число активных натуралистов по годам (рис. 3), то можно увидеть, что реально первым годом iNaturalist в России стал 2018. Хотя находки публикуют с 2011 года, до 2017 это делали не более 20 человек в год, поэтому эти значения на графике почти не видны. В 2018 году продолжили собирать находки 35% натуралистов (из тех, кто ранее что-то публиковал), в 2019 - 28 %, в 2020 (на сегодняшний день) - пока что только 17%, при этом абсолютные числа растут: 11 в 2017, 31 в 2018, 462 в 2019 и уже 861 в 2020. Будем надеяться, что после снятия ограничительных мер из-за пандемии пробудится еще больше.
Также интересно взглянуть на график динамики активности натуралистов по неделям (здесь в отличие от предыдущего графика значения не суммируются). Можно увидеть небольшие пики майских праздников 2018 и 2019, зимних каникул 2019 и 2020, повышенную активность по загрузке наблюдений в конце 2018. Также обращает на себя резкий рост активных с начала марта, при том что новые натуралисты прибывают не намного большими темпами.

Два примечания: во-первых, данные по динамики приведены до начала City Nature Challenge 2020, специфику и последствия этого явления надо рассматривать отдельно; во-вторых, здесь учитывается дата публикации находок, вне зависимости от того, когда наблюдение было сделано.



Publicado em 26 de abril de 2020, 02:36 TARDE por max_carabus max_carabus | 1 comment | Deixar um comentário

25 de março de 2020

1339 наблюдений за день

После дозагрузки пользователями наблюдений, сделанных в предыдущие дни, оказалось, что наибольшее число наблюдений сделано в прошедшую субботу 21 марта - 1339 (121 пользователь).
Это максимальный показатель для этого года. В субботу на позапрошлой неделе 14 марта сделано 1272 наблюдений 133 натуралистами. Это наибольшие значения с середины сентября прошлого года.
Погода теплеет - уже много где цветут эфемероиды (недели на 2-3 раньше !!! чем обычно как минимум) и появляются первые бабочки https://www.inaturalist.org/observations/40684343
Ждем роста активности натуралистов

Publicado em 25 de março de 2020, 09:06 TARDE por max_carabus max_carabus | 0 comments | Deixar um comentário

21 de março de 2020

Новая модель автоматического определения

После досрочного схода снега во многих регионах России нарастает полевая активность участников iNaturalist. В прошлую субботу - 14 марта было сделано 1204 наблюдения - рекорд для этого года и максимальное число наблюдений, сделанных за один день, с середины сентября прошлого года.
Тем временем в сети iNaturalist включили новую модель компьютерного зрения, которая предлагает вам варианты автоматического определения по загружаемым фотографиям. И об этом надо рассказать немного подробнее.
Компьютерное зрение - это передовая технология, основанная на машинном обучении, которая служит для распознавания и классификации объектов на растровом изображении - фотографии или видеозаписи. Подобные технологии наиболее востребованы, например, в сфере разработки беспилотных систем управления транспортом.
Некоторые нюансы применения подобной технологии в iNaturalist нуждаются в пояснении.
Первое - обновление модели распознавания происходит не каждый день. Обучение нейросети и её применения - это два отдельных процесса, причем первый требует большого объема компьютерных ресурсов. Обучение актуальной (пятой) версии модели, основанной более чем на 12 млн. изображений, было начато 29 сентября 2019 года и заняло 140 (!!!) дней.
Второе - есть ограничение на то, какие виды представлены в системе автоматического определения. Должно быть как минимум 100 находок с корректными значениями необходимых атрибутов и как минимум 50 определений участниками iNaturalist. Из набора данных для обучения модели распознавания исключаются наблюдения, в которых хотя бы одно значение помечено как сомнительное (“неточные координаты”, например). Наблюдения домашних и содержащихся в неволе животных учитываются, так же как и культивируемых растений.
В процессе разработки системы автоматического определения техническую поддержку оказывают фирмы Nvidia и Microsoft.
Через какое-то время начнётся обучение новой модели и в неё могут найти и ваши наблюдения тоже. Делайте качественные фотографии и присваивайте им открытую лицензию: CC-BY или CC-BY-NC.

Оригинал новости можно увидеть здесь:
https://www.inaturalist.org/blog/31806-a-new-vision-model

Publicado em 21 de março de 2020, 07:15 TARDE por max_carabus max_carabus | 0 comments | Deixar um comentário

11 de fevereiro de 2020

Биоразнообразие Югры

Добавлен еще один региональный проект - Биоразнообразие Югры (Ханты-Мансийский автономный округ).

Теперь здесь представлено 19 регионов

Publicado em 11 de fevereiro de 2020, 09:19 MANHÃ por max_carabus max_carabus | 0 comments | Deixar um comentário

10 de fevereiro de 2020

Полмиллиона наблюдений!

Добрый день! Число наблюдений в iNaturalist для России перевалило за 500 000 !!! Из которых более 400 тыс. исследовательского уровня. Во всем мире на сегодняшний день сделано более 31 млн. находок и для территории России доля составляют только 1.6%, вроде совсем немного. НО !!!
Из всех находок в iNaturalist определение подтверждено примерно для 61%, в России - 81%, то есть и эксперты работает на высоком уровне и участники выкладывают качественные фотографии. Кроме того, натуралистов по всему миру 851 290, в России 6 510, % соотношение еще меньше, НО на одного натуралиста в России приходится в среднем 77 находок, при общемировом уровне в 36. Естественно, активность любителей разная - 115 человек сделали более 1000 находок и их общий вклад составляет около 70 % от всех находок.

Учитывая, что за прошлый год для России было добавлено почти 400 тыс записей, а с начала этого года - более 50 тыс., то до первого миллиона в общем-то недалеко, учитывая, что число пользователей растёт. Тут надо еще заметить, что из тех находок, которые добавлены с начала года, более 70% относятся к более раннему времени, вплоть до 10 и более лет назад - участники активно разбирают и публикуют свои архивы фотографий. 

Publicado em 10 de fevereiro de 2020, 08:03 TARDE por max_carabus max_carabus | 0 comments | Deixar um comentário

Arquivos